La Escuela de Ciencias Agrarias ofrece maestrías en Agricultura Ecológica, Desarrollo Rural, Desarrollo Comunitario Sustentable y Gerencia de la Seguridad Alimentaria y Nutricional, orientadas a formar profesionales capaces de responder a los desafíos sociales, ambientales y agroalimentarios de la región. Estos programas integran la investigación, el conocimiento interdisciplinario y la aplicación práctica para promover sistemas productivos sustentables, fortalecer las comunidades y mejorar la calidad de vida de la población. Su enfoque crítico, participativo e inclusivo, junto con las modalidades virtuales disponibles en varias de estas maestrías, favorece el acceso a la formación de posgrado y el intercambio de experiencias entre profesionales de distintos territorios.